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基因组DNA提取/植物基因组DNA小量抽提试剂盒(磁珠法)
植物基因组DNA小量抽提试剂盒(磁珠法)
植物基因组DNA小量抽提试剂盒(磁珠法)
植物基因组DNA小量抽提试剂盒(磁珠法)
采用磁珠结合吸附的方式,能够快速分离纯化提取植物基因组DNA,适用于不同植物物种和组织类型如根、茎、叶、芽等样品。


产品货号

产品规格

目录价

促销价

HX3003S

50次

432.00

388.00

HX3003M

200次

1332.00

1198.00


产品信息

本试剂盒采用磁珠结合吸附的方式,能够快速分离纯化提取植物基因组DNA,无需使用有毒的苯酚-氯仿提取或耗时的酒精沉淀,洗涤过程无需高速离心,更安全、便捷、快速且节约时间,适用于不同植物物种和组织类型如根、茎、叶、芽等样品。植物样品在液氮研磨后与裂解液孵育,或在裂解液中进行研磨,然后离心取上清溶液,加入适量无水乙醇混匀后与磁珠孵育,释放出来的基因组DNA在特定条件下与磁珠特异性结合。在外界磁场(如磁分离架)的作用下,磁珠与相应溶液可以快速高效地分离。随后通过两次洗涤去除各种杂质,最后通过洗脱液将DNA从磁珠上洗脱下来。整个过程无需酚氯仿抽提,无需酒精沉淀,样品裂解后仅需约15 min即可完成。纯化得到的植物基因组DNA的长度最长可达50 kb左右,平均为30 kb左右,最短为100 bp的DNA也可以被纯化。可以从10-100 mg植物样品中抽提获得约1-15 μg的基因组DNA,OD260/OD280的范围通常在1.6至1.9之间。可以根据植物材料不同调整起始重量,使用的样品过多反而会影响抽提效果。按照本试剂盒的标准操作步骤抽提得到的植物基因组DNA会含有少量的RNA,但如果按照可选步骤加入适量的DNase free的RNase A,就可以获得不含RNA的高纯度总DNA。含有RNA的总DNA可以用于PCR,但对于某些其它的后续反应可能会产生一些影响。本试剂盒中的磁珠,每20 µl磁珠悬浮液对于DNA的最大结合容量约为30 μg。本试剂盒小包装和中包装分别可以抽提50个和200个植物样品的基因组DNA。


产品应用

快速分离纯化提取植物基因组DNA。


产品保存

蛋白酶K -20ºC保存,其余均室温保存,一年有效。其中磁珠悬浮液长期不使用时,4ºC保存,可以保存更长时间。蛋白酶K室温(15-25ºC)存放一周,活力无明显下降。


产品组分

组分编号

组分名称

组分规格

HX3003-1

磁珠悬浮液

1.1 ml

4.4 ml

HX3003-2

样品裂解液A

28 ml

110 ml

HX3003-3

样品裂解液B

28 ml

110 ml

HX3003-4

洗涤液I(首次使用前加入11/44 ml无水乙醇)

33 ml

132 ml

HX3003-5

洗涤液II(首次使用前加入33/132ml无水乙醇)

22 ml

88 ml

HX3003-6

洗脱液

15 ml

60 ml

HX3003-7

蛋白酶K

1.1 ml

4.4 ml


注意事项

1. 尽可能使用新鲜的植物样品,以确保提取获得完整的、质量较高的基因组DNA。小心使用液氮,防止被液氮冻伤。样品从液氮中取出时,应立即打开管盖防止温差造成的离心管炸裂,同时液氮研磨样品时需不断添加液氮。

2. 需自备磁分离装置,配合使用水浴锅/金属浴仪、电动研磨仪/研钵、研磨棒、涡旋振荡器、高速离心机,某些步骤需使用55ºC和65ºC水浴,请提前作好准备。除特别说明外,每次Vortex应控制在5-10 sec左右。所有操作均在室温进行,操作时无需冰浴。

3. 蛋白酶K对人体有呼吸道、生殖等特定器官毒性,或致畸致癌毒性,操作时请特别小心,并注意有效防护以避免直接接触人体或吸入体内。

4. 如需制备不含RNA的高纯度基因组DNA,需自备DNase free的RNase A。

5. 温度较低时样品裂解液A或样品裂解液B中可能会有沉淀产生,属正常现象。使用前必须检查一遍。如有沉淀,55ºC水浴孵育使沉淀溶解,混匀后使用。

6. 磁珠在静置后会发生沉降,使用前一定要适当涡旋震荡或颠倒数次至充分混匀。磁分离前应适度震荡离心管使磁珠充分分散后再靠近磁场。如果出现磁珠挂壁现象,可以在磁珠聚集后晃动管内液体,使挂壁的磁珠流下。请使用推荐的样品量。如果样品量过大,可能造成磁珠聚集,会影响洗涤进而影响抽提获得的DNA纯度。发生磁珠聚集时,洗涤时需尽量分散磁珠,这样可有效改善抽提效果。如果发生磁珠聚集现象,建议在后续实验中适当减少样品用量。请勿长时间干燥磁珠,干燥过度将导致磁珠不可逆的聚集,从而降低洗脱效率。

7. 首次使用前洗涤液I需添加11 ml/44 ml无水乙醇,洗涤液II需添加33 ml/132 ml无水乙醇,混匀,并在瓶上做好标记。洗涤液I和洗涤液II对人体有害或有刺激性,操作时请小心,并注意有效防护以避免直接接触人体或吸入体内。

8. 洗脱磁珠上的DNA时,可以将洗脱液加热至65ºC,能够提高植物基因组DNA的洗脱效率。

1. 采集10-100 mg的新鲜植物材料或20 mg干重植物材料于1.5 ml管中,加入液氮进行充分研磨。

2. 加入500 μl样品裂解液A,Vortex混匀。

3. 加入20 µl蛋白酶K,Vortex混匀,55ºC水浴孵育至完全裂解。

4. (选做)清除RNA,如果希望获得不含RNA的高纯度总DNA,加入2 μl 100 mg/ml RNase A,Vortex混匀。室温(15-25ºC)放置2 min。

5. 加入500 µl样品裂解液B,Vortex混匀,65ºC孵育20 min。将孵育后的植物样品溶液,室温8000×g离心10 min。取离心后的上清溶液转移至新的1.5 ml离心管中,加入200 µl无水乙醇,Vortex混匀。

6. 将混合物加入20 µl磁珠悬液(使用前务必混匀),轻柔混匀后,室温放置3-5 min。将离心管置于磁力架的磁场中,待磁珠完全聚集后,小心吸除残液。

7. 加入800 µl洗涤液I(使用前请确认是否已加入无水乙醇),轻柔震荡使磁珠分散开,颠倒两次后将离心管置于磁力架的磁场中,待磁珠完全聚集后,尽量吸净残液。

8. 加入1 ml洗涤液II(使用前请确认是否已加入无水乙醇),轻柔震荡使磁珠分散开,颠倒两次后将离心管置于磁力架的磁场中,待磁珠完全聚集后,尽量吸净残液。

9. 将离心管室温放置5-10 min,或置于37ºC鼓风烘箱5 min,确保残留的乙醇等微量液体完全挥发。

10. 加入50-100 μl洗脱液,轻柔震荡使磁珠悬于溶液中,65ºC孵育3-5 min,其间甩动离心管1-2次。将离心管置于磁场中,待磁珠完全聚集后,小心吸取溶液至新离心管中,置于-20ºC保存,所得溶液即为纯化的总DNA。

11. 可通过1%琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计测量样品在OD260 nm和OD280 nm处的吸光值和OD260/OD280的比值。OD260数值为1时相当于大约50 μg/ml的双链DNA、40 μg/ml的单链DNA。如果使用去离子水进行洗脱,OD260/OD280比值会偏低,但不代表纯度低。

注:

1) 请勿使用过多的样品,否则会导致抽提效果下降。新鲜或冻存的植物样品均可,对于水分较多或DNA含量低的植物材料可适当增加样本量。充分研磨是提取高质量DNA的关键,可提高裂解效果。研磨后的植物样品如果不立刻进行后续操作步骤,可在80ºC冻存,切勿反复冻融。

2) 加入裂解液A前请确保研磨后的粉末恢复至室温,否则容易vortex不充分,造成裂解不完全。也可以不进行液氮冷冻和研磨,而是在加入500 μl样品裂解液A后,使用适当的研磨或匀浆设备进行研磨或匀浆。

3) 在步骤3 蛋白酶K孵育期间可以偶尔取出样品Vortex以加快裂解速度。裂解的时间因组织不同而有所不同,通常可在1-3 h内完成。

4) RNase A可根据抽提的量的多少调整用量。如果残余的少量RNA对后续实验没有干扰,可以不进行本步骤的实验操作。

5) 加入样品裂解液B后需立即Vortex混匀,孵育期间可以取出样品Vortex 1-2次,可加快裂解速度并确保沉淀不聚集在管底。

6) 离心后的上清溶液加入200 µl无水乙醇后必须充分混匀,否则会严重影响抽提效果。加入乙醇后可能产生白色沉淀,属正常现象,后续步骤中必须把白色沉淀和溶液全部用于和磁珠的结合,沉淀不会影响抽提效果。磁珠在使用前一定要涡旋或震荡混匀。如有必要,可适当增加磁珠用量,延长结合时间以提高得率。

7) 如需获得更高浓度的样品,可把洗脱液的体积减小至50 µl,但洗脱下来的DNA量会相对减少。此外,洗脱后的溶液再次加回到原磁珠再洗脱一次,可提高得率约10-30%;或者在第一次洗脱后使用新的洗脱液再洗脱一次,会获得约为第一次洗脱量15-40%的DNA。

Q:为什么纯化获得的基因组DNA偏少?

A: 与植物材料样品有关,有些植物的DNA产量本身较低(如拟南芥推荐起始量为200 mg),样品较老、不新鲜、水分含量多和多糖多酚含量较高等,植物材料样品过多或植物样品研磨不充分,导致裂解不充分,此时可适当减少植物材料用量,并充分研磨;裂解液A中出现沉淀未溶解,未能和样品充分裂解,孵育裂解时间过短或过长,一般建议孵育时间不短于15 min,不超过60 min;磁珠结合不充分,加入磁珠后应充分混匀,始终处于悬浮状态。磁珠残留乙醇,确保离心管开盖晾至干燥,使残留在磁珠上的乙醇完全挥发。磁珠在洗涤步骤时造成了部分损失,可用少量洗涤液吹打管口,使粘在管口的磁珠吸附在离心管壁上;洗涤液中未加入无水乙醇,基因组DNA抽提效率下降;洗脱不充分,可适当增加洗脱体积或洗脱次数,或在65ºC水浴中洗脱样品,可提高DNA洗脱效率。

Q:为什么基因组DNA纯度不高?

A:未加入RNase A,可按使用说明的要求加入清除RNA的步骤;磁珠残留乙醇,确保离心管开盖晾至干燥,使残留在磁珠上的乙醇完全挥发;洗涤不充分。

Q:为什么DNA完全或部分降解?

A:环境中DNase污染;植物取材不新鲜或反复冻融,可以取新鲜植物样品,低温保存来避免;提取过程操作过于剧烈,可以在裂解后的操作适当轻柔。

Q:为什么电泳的DNA条带拖带弥散或加样孔位置较亮?

A:DNA上样量过多,可以按照胶孔体积适当加入;有蛋白等杂质污染;DNA完全或部分降解;电泳条件不对或需要更换使用新的电泳缓冲液;一些较大的基因组会堵在孔中,较难发生电泳迁移,造成孔内较亮。琼脂糖凝胶浓度较高会造成孔内较亮,合适的凝胶浓度通常宜为0.8-1%。

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