三代测序全长转录组,生信分析软件到底怎么选?
做三代转录组(PacBio Iso-Seq/ONT cDNA/direct RNA)的同学,几乎都纠结过同一个问题:isoform 鉴定到底用哪个软件?
这个领域工具迭代非常快,StringTie2、FLAIR、FLAMES、Freddie、TALON、UNAGI、TAMA、Bambu、IsoQuant……每个工具发表时都宣称自己“表现优异”,但单独看原文很难横向比较。
本期让大家可以根据自己的需求去更快更有效地选择合适的工具及模式。
2026-09-15