服务内容-核序生物

Data Services

数据服务

In-depth analysis of transcriptomics data转录组学数据深度分析
In-depth analysis of translationomics data翻译组学数据深度分析
Protein and complex structure analysis蛋白质及复合物结构解析
Structural prediction结构预测
Drug target analysis药物靶点分析

转录组学数据深度分析

转录组学数据深度分析服务针对RNA-seq、single-cellRNA-seq（scRNA-seq）、total RNA-seq、polyA RNA-seq、CAGE-seq 等高通量测序数据，提供系统性的表达调控解析。核序可进行基因表达定量分析、可变剪切（alternative splicing）事件检测、融合基因（fusion genes）识别、RNA编辑（RNA editing）分析等。同时，核序深入挖掘差异表达基因（DEGs）、共表达网络（WGCNA）、转录因子调控（TF analysis）、RNA结构特征等信息，结合非编码RNA（lncRNA,circRNA,miRNA）分析，探索基因表达的层级调控。此外，核序还可结合时序分析、基因集富集（GO/KEGG）分析及调控网络推断，解析关键信号通路和调控因子，为功能基因研究、疾病机制解析、个性化医学及生物制药提供高质量的数据支持。

翻译组学数据深度分析

翻译组学数据深度分析服务提供Ribo-seq、5P-seq、TRAP-seq等高通量翻译组学数据的系统解析，帮助研究人员全面解读基因翻译调控机制。核序精准计算翻译效率（TE）和翻译速率（ribosome elongation rate），并进行翻译起始（translation initiation）与翻译终止（translation termination）的特征表征。此外，核序可以基于ribosome footprinting 数据计算翻译停滞评分（stalling score），系统挖掘核糖体停滞的潜在机制及调控通路。同时，核序对差异基因的序列特征、结构特征等进行深入分析，以识别影响翻译过程的关键调控因素，为研究翻译调控、蛋白质合成调节及相关疾病机制提供高分辨率的数据支持。

蛋白质及复合物结构解析

蛋白质及复合物结构解析服务专注于高分辨率结构数据处理与分析，主要针对X射线晶体学和单颗粒冷冻电镜（Cryo-EM）数据。核序提供数据预处理、三维重构、模型构建与精修等专业服务，确保获得高质量的蛋白质及其复合物结构。此外，核序还进行初步结构分析，包括二级结构特征、关键结合位点识别、构象变化评估等，帮助研究人员深入理解蛋白质功能及相互作用机制，为结构生物学研究、药物靶点解析及生物工程优化提供可靠的结构信息支持。

结构预测

结构预测服务致力于利用先进的计算建模与人工智能技术，精准预测蛋白质及其复合物的三维结构。核序提供蛋白质结构预测（基于AlphaFold、Rosetta 等前沿算法）、蛋白-蛋白相互作用建模、蛋白-RNA/DNA 复合物结构预测及蛋白-小分子复合物建模，并通过分子动力学模拟（MD Simulation）、结合自由能计算等方法解析关键相互作用特征。该服务不仅适用于未知蛋白质结构解析，还可用于生物大分子相互作用研究、靶向药物设计及生物工程优化，为精准医学、合成生物学和生物技术研究提供强有力的结构信息支持。

药物靶点分析

药物靶点分析服务旨在通过先进的计算模拟和结构预测方法，精准识别蛋白质上的潜在小分子结合靶点。基于高分辨率蛋白结构数据，核序采用分子对接（molecular docking）、分子动力学模拟（molecular dynamics simulation）以及基于机器学习的靶点预测算法，预测小分子与蛋白的可能结合位点及相互作用模式。该分析不仅有助于筛选潜在的药物结合位点，还能提供蛋白-小分子复合物的结合亲和力评估，为新药研发中的先导化合物优化、结构改造及靶向设计提供精准指导，加速药物发现和开发进程。