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体外转录酶/SP6 RNA Polymerase
SP6 RNA Polymerase
SP6 RNA Polymerase
SP6 RNA Polymerase
一种高度特异识别SP6启动子序列的DNA依赖的5'→3' RNA聚合酶。


产品货号

产品规格

目录价

促销价

HX2009S

1 KU

151.00

136.00

HX2009M

5 KU

459.00

413.00

HX2009L

25 KU

1610.00

1449.00

HX2009XL

100 KU

5409.00

4868.00


产品信息

SP6 RNA Polymerase,即SP6 RNA聚合酶,是一种高度特异识别SP6启动子序列的DNA依赖的5'→3' RNA聚合酶。SP6 RNA Polymerase可以催化单链或双链DNA SP6 启动子下游NTP的掺入,合成与SP6启动子下游的模板DNA互补的RNA。

SP6 RNA Polymerase不仅可以进行常规的RNA合成,还可以识别修饰的NTP,例如生物素标记、地高辛标记、荧光素标记的NTP,可以用于各种标记RNA的合成。同时对于SP6启动子有高度的特异性。


产品应用

用于RNA合成,合成的RNA可以用于或用作:杂交探针,基因组DNA序列分析,核糖核酸酶保护测定(RNase protection assay),反义RNA合成,作为体外翻译的RNA模板,RNA剪接研究的底物,RNA二级结构和RNA-蛋白质相互作用,核酸扩增分析,siRNA、miRNA等小RNA。


产品保存

-20℃保存。


产品组分

组分编号

组分名称

组分规格

HX2009-1

SP6 RNA Polymerase (20 U/µl)   

50 µl

250 µl

1.25 ml

1.25 ml×4

HX2009-2

10X SP6 Transcription   Buffer

100 µl

500 µl

1.25 ml×2

1.25 ml×8


注意事项

1. 酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。

2. 本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

1. RNA合成:

a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。

b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。

c. 参考如下表格设置反应体系:

试剂

体积

10X SP6 Transcription Buffer  

2 µl

NTP Mixture (10 mM each)

4 µl

线性DNA模板

0.2-1 µg

Ribonuclease Inhibitor (40 U/µl)

0.5 µl

SP6 RNA Polymerase (20 U/µl)

0.8-2 µl  

补充经DEPC处理的去离子水

至20 µl

d. 按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用 Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。

e. 37ºC 孵育1~2 h。

f. 加入2 µl 0.5 M EDTA (pH 8.0)到反应体系中混匀或-20ºC冷却终止反应。

g. 电泳分析转录产物,或通过其他适当方法鉴定转录的效率

注:

1) 转录需在无RNA酶条件下进行。

2) 反应体系需在室温条件下配置,4ºC有亚精胺(spermidine)存在时DNA可发生沉淀。按以上反应条件,每1 µg 模板DNA可合成超过10 µg的RNA。

3) 如果模板DNA的线形化不太完全,会导致转录出比预期长度更长的RNA,同时使预期长度的转录本比例下降。

4) 可根据实际情况按照比例放大或缩小上述反应体系。


2. 放射标记RNA的合成:

a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。

b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。

c. 参考如下表格设置反应体系:

试剂

体积

10X SP6 Transcription Buffer

2 µl

3 NTP Mixture (10 mM each , without CTP)

1 µl

100 µM CTP

2.4 µl

[α-32P]-CTP, ~30TBq/mmol (800 Ci/mmol)

1.85 MBq (50 µCi)

线性DNA模板

0.2~1 µg

Ribonuclease Inhibitor (40 U/µl)

0.5 µl

SP6 RNA Polymerase (20 U/µl)

1-2 µl

补充经DEPC处理的去离子水

至20 µl

d. 37ºC孵育1~2 h。

e. -20ºC冷却终止反应。

f. 分析和检测RNA的标记效率。

注:

1) 按以上方法合成的RNA活性一般为3-5 ×108 dpm/µg。

2) 上述标记反应中也可以使用[32P]、[35S]或[3H]标记的其他NTP。使用其他放射性标记的NTP时,其他的NTP需作相应调整。20 µl反应体系各成分推荐使用剂量分别为:1.85 MBq (50 µCi) 5'-[α-32P]-CTP, ~30 TBq/mmol (800 Ci/mmol);11.1 MBq (300 µCi) 5'-[α-35S]-UTP, >37 TBq/mmol (>1000 Ci/mmol);0.925 MBq (25 µCi) 5,6-[3H]-UTP, 1.1-2.2 TBq/mmol (30-60 Ci/mmol)。

3) 放射性标记NTP浓度低于12 µM时,全长转录本合成效率也会下降。

Q:转录效率低(RNA产量低)怎么办?

A:纯化模板DNA(线性化质粒或PCR产物),确保启动子完整,验证启动子序列(SP6启动子:ATTTAGGTGACACTATAG)。使用新鲜NTP(建议终浓度0.5-1 mM),优化Mg²⁺浓度(可梯度测试4-8 mM),分装酶避免反复冻融,短期保存于-20℃,长期于-80℃。

Q:含有非特异性转录(杂带或长片段)怎么办?

A:彻底线性化模板(酶切后凝胶验证,避免残留超螺旋DNA)。纯化模板(如凝胶回收或柱纯化)。减少酶用量或缩短反应时间(通常1-2 h足够)。

Q:转录后RNA降解怎么办?

A:使用RNase-free耗材(DEPC处理水、枪头等)。添加RNase抑制剂(如RNasin)。转录后立即置于冰上,长期保存于-80℃(可加EDTA螯合金属离子)。

Q:有副产物(如dsRNA或双链)怎么办?

A: 纯化单链模板或设计单向转录载体。优化模板序列(避免反向重复或互补区)。

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