产品货号 | 产品规格 | 目录价 | 促销价 |
HX2008S | 1 KU | 148.00 | 133.00 |
HX2008M | 5 KU | 458.00 | 412.00 |
HX2008L | 25 KU | 1609.00 | 1448.00 |
HX2008XL | 100 KU | 5408.00 | 4867.00 |
▍产品信息
T3 RNA Polymerase,即T3 RNA聚合酶,是一种高度特异识别T3启动子序列的DNA依赖的5'→3' RNA聚合酶。T3 RNA Polymerase可以催化单链或双链DNA T3 启动子下游NTP的掺入,合成与T3启动子下游的模板DNA互补的RNA。
特点:T3 RNA Polymerase不仅可以进行常规的RNA合成,还可以识别修饰的NTP,例如生物素标记、地高辛标记、荧光素标记的NTP,可以用于各种标记RNA的合成。同时对于T3启动子有高度的特异性。
▍产品应用
用于RNA合成,合成的RNA可以用于或用作:杂交探针,基因组DNA序列分析,核糖核酸酶保护测定(RNase protection assay),反义RNA合成,作为体外翻译的RNA模板,RNA剪接研究的底物,RNA二级结构和RNA-蛋白质相互作用,核酸扩增分析,siRNA、miRNA等小RNA。
▍产品保存
-20℃保存
▍产品组分
组分编号 | 组分名称 | 组分规格 | |||
HX2008-1 | T3 RNA Polymerase (50 U/µl) | 20 µl | 100 µl | 500 µl | 2.0 ml |
HX2008-2 | 10X T3 Transcription Buffer | 25 µl | 120 µl | 600 µl | 1.2 ml×2 |
▍注意事项
1. 酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。
2. 本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
1. RNA合成:
a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。
b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。
c. 参考如下表格设置反应体系:
体积 | |
10X T3 Transcription Buffer | 2 µl |
NTP Mixture (10 mM each) | 4 µl |
线性DNA模板 | 0.2-1 µg |
Ribonuclease Inhibitor (40 U/µl) | 0.5 µl |
T3 RNA Polymerase (50 U/µl) | 0.8-2 µl |
补充经DEPC处理的去离子水 | 至20 µl |
d. 按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用 Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
e. 37ºC 孵育1~2 h。
f. 加入2 µl 0.5 M EDTA(pH 8.0)到反应体系中混匀或-20ºC冷却终止反应。
g. 电泳分析转录产物,或通过其他适当方法鉴定转录的效率
注:
1) 转录需在无RNA酶条件下进行。
2) 反应体系需在室温条件下配置,4ºC有亚精胺(spermidine)存在时DNA可发生沉淀。按以上反应条件,每1 µg 模板DNA可合成超过10 µg的RNA。
3) 如果模板DNA的线形化不太完全,会导致转录出比预期长度更长的RNA,同时使预期长度的转录本比例下降。
4) 可根据实际情况按照比例放大或缩小上述反应体系。
2. 放射标记RNA的合成:
a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。
b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。
c. 参考如下表格设置反应体系:
试剂 | 体积 |
10X T3 Transcription Buffer | 2 µl |
3 NTP Mixture (10 mM each , without CTP) | 1 µl |
100 µM CTP | 2.4 µl |
[α-32P]-CTP, ~30TBq/mmol (800 Ci/mmol) | 1.85 MBq (50 µCi) |
线性DNA模板 | 0.2~1 µg |
Ribonuclease Inhibitor (40 U/µl) | 0.5 µl |
T3 RNA Polymerase (50 U/µl) | 1 µl |
补充经DEPC处理的去离子水 | 至20 µl |
d. 37ºC孵育1~2 h。
e. -20ºC冷却终止反应。
f. 分析和检测RNA的标记效率。
注:
1) 按以上方法合成的RNA活性一般为3-5 ×108 dpm/µg。
2) 上述标记反应中也可以使用[32P]、[35S]或[3H]标记的其他NTP。使用其他放射性标记的NTP时,其他的NTP需作相应调整。20 µl反应体系各成分推荐使用剂量分别为:1.85 MBq (50 µCi) 5'-[α-32P]-CTP, ~30 TBq/mmol (800 Ci/mmol);11.1 MBq (300 µCi) 5'-[α-35S]-UTP, >37 TBq/mmol (>1000 Ci/mmol);0.925 MBq (25 µCi) 5,6-[3H]-UTP, 1.1-2.2 TBq/mmol (30-60 Ci/mmol)。
3) 放射性标记NTP浓度低于12 µM时,全长转录本合成效率也会下降。
Q:转录效率低(RNA产量低)怎么办?
A:纯化模板DNA(琼脂糖凝胶电泳验证完整性),确认模板包含完整的T3启动子序列(5'-ATTAACCCTCACTAAAG-3')。优化反应体系:NTPs(0.5-1 mM)、Mg²⁺(4-8 mM)、pH(7.5-8.0)。分装酶避免反复冻融,储存于-20℃。
Q:RNA产物长度异常什么原因?
A:模板线性化不完全(环状DNA导致连续转录),RNAse污染导致降解,提前终止(二级结构或序列障碍)。
Q:有非特异性转录怎么办?
A:重新设计模板,确保单一启动子,降低酶用量(通常0.5-1 U/μL足够),纯化模板(如酚氯法去除杂蛋白)。
Q:有副产物(如dsRNA或双链)怎么办?
A: 确保模板为单链或单向转录设计或添加RNase III或热变性模板后再转录。