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分子生物学/分子工具酶-其他工具酶
分子工具酶-其他工具酶
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本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内
产品货号产品规格目录价促销价
123088T445.00445.00
1232424T1785.001785.00
1239696T3385.003385.00
12100100T15255.0015255.00

核序生物Ribo-seq试剂盒用于高通量测序文库的制备,专门针对核糖体保护的mRNA片段的测序文库制备。该试剂盒通过高效、简便的实验流程,帮助研究人员快速获得高质量的Ribo-Seq数据。核序生物Ribo-seq试剂盒兼容MGI和Illumina高通量测序平台,同时也兼容不同测序平台的 Full Adapter 和 Truncated Adapter。RNA起始量在100 ng-1 μg。

Ribo-seq技术在癌症、代谢疾病等研究中广泛应用,通过测序核糖体保护的mRNA片段,揭示基因表达调控的细节。试剂盒中每种试剂都经过了严格的质量控制,适用于低样本量实验,提高建库效率。且每一批次的建库试剂盒都经过了建库和上机测序的验证,保证每一批次的试剂盒性能质量稳定。

核序生物Ribo-seq试剂盒需要搭配rRNA剔除模块,及接头试剂盒相关产品。

  • 高灵敏度:适用于低输入量的RNA样本,确保低丰度转录本的检测。
  • 快速便捷:优化的实验流程,缩短建库时间,提高实验效率。
  • 高重复性:保证样本间的高度一致性,便于数据比对和分析。
  • 兼容性强:适用于多种样本类型,包括动物细胞、组织、植物、真菌和临床样本。
  • 产品保存:-20℃
  • 产品组分:
组分编号组分名称8次24次96次100次
12309NucleaseXXXX
12398mRNA Capture BeadsXXXX
12387Beads Binding BufferXXXX
12376Beads Wash BufferXXXX
12365Ligation EnhancerXXXX
12354Novel T4 DNA LigaseXXXX

使用说明:

1、本试剂盒提供完整的核糖体图谱分析(Ribo-seq)解决方案,包含核糖体保护片段(RPFs)提取、RNA片段化、文库构建及纯化所需试剂,适用于翻译组学研究。

2、使用新鲜或液氮速冻的细胞(≥1×10^6个),裂解后离心获取上清液。推荐添加环己酰亚胺(终浓度100 μg/mL)以稳定核糖体。

3、加入10 μL RNase I(试剂盒提供),25°C消化45分钟。使用离心柱(试剂盒内附)纯化RPFs,洗脱体积30 μL。

常见问题:

Q1:RPFs产量低可能的原因?

细胞裂解不彻底:优化裂解缓冲液比例或延长裂解时间。

RNase I活性不足:检查酶保存条件(避免反复冻融)或延长消化时间。

Q2:测序数据中rRNA污染高如何解决?

建议在文库构建前使用rRNA去除试剂盒(如Ribo-Zero)。

检查RNase I消化效率,确保核糖体未被过度降解。

Q3:文库片段大小异常(非28 nt)?

可能因RNA片段化时间过长:缩短70°C反应至5-8分钟。

检查T4 PNK酶活性,确保末端修复完整。

Q4:试剂盒可兼容哪些测序平台?

默认适配Illumina平台(兼容PE50/PE100),如需其他平台接头需定制。

参考文献:

Ingolia, N.T. et al. (2009). Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling. Science, 324(5924), 218-223.

试剂盒优化方案:*[附件]RB-1000_Optimization_Guide.pdf*

产品编号产品名称包装
12309NucleaseXXXXXX
12398mRNA Capture BeadsXXXXXX
12387Beads Binding BufferXXXXXX
12376Beads Wash BufferXXXXXX
12365Ligation EnhancerXXXXXX
12354Novel T4 DNA LigaseXXXXXX
使用本产品的文献或相关技术文章:

标题:High-resolution ribosome profiling reveals dynamic translational regulation in response to oxidative stress

作者:Zhang L, et al. (2025)

期刊:Nucleic Acids Research (IF: 16.8)

摘要:
使用RB-1000 Ribo-seq试剂盒对HEK293T细胞进行核糖体图谱分析,揭示了氧化应激下哺乳动物细胞中UORF(上游开放阅读框)介导的翻译重编程机制。数据表明,试剂盒的低噪音特性可有效捕获短肽(<10 aa)的翻译事件。

使用本产品的文献或相关技术文章:

标题:High-resolution ribosome profiling reveals dynamic translational regulation in response to oxidative stress

作者:Zhang L, et al. (2025)

期刊:Nucleic Acids Research (IF: 16.8)

摘要:
使用RB-1000 Ribo-seq试剂盒对HEK293T细胞进行核糖体图谱分析,揭示了氧化应激下哺乳动物细胞中UORF(上游开放阅读框)介导的翻译重编程机制。数据表明,试剂盒的低噪音特性可有效捕获短肽(<10 aa)的翻译事件。

1. 实验设计与样本准备

Q1.1:该试剂盒适用于哪些物种?

支持广泛物种:包括哺乳动物(人、小鼠、大鼠)、植物(拟南芥、水稻)、酵母、细菌等。针对不同物种,可调整 RNase I消化时间(如细菌建议15-20分钟,哺乳动物建议45分钟)。

Q1.2:最低需要多少细胞量?

推荐起始量:

常规实验:≥1×10^6 个细胞(可获得高信噪比数据)。

低起始量优化:使用 低输入版本(RB-1000-LI) 可低至 5×10^4 个细胞(需搭配rRNA去除步骤)。

Q1.3:是否需要添加翻译抑制剂(如环己酰亚胺)?

建议添加:

在细胞裂解前加入 环己酰亚胺(CHX, 100 μg/mL) 以稳定核糖体。

若研究翻译动态(如应激响应),可尝试 Harringtonine(哈林顿碱) 进行起始位点捕获。

2. 实验设计与样本准备

Q1.1:该试剂盒适用于哪些物种?

支持广泛物种:包括哺乳动物(人、小鼠、大鼠)、植物(拟南芥、水稻)、酵母、细菌等。针对不同物种,可调整 RNase I消化时间(如细菌建议15-20分钟,哺乳动物建议45分钟)。

Q1.2:最低需要多少细胞量?

推荐起始量:

常规实验:≥1×10^6 个细胞(可获得高信噪比数据)。

低起始量优化:使用 低输入版本(RB-1000-LI) 可低至 5×10^4 个细胞(需搭配rRNA去除步骤)。

Q1.3:是否需要添加翻译抑制剂(如环己酰亚胺)?

建议添加:

在细胞裂解前加入 环己酰亚胺(CHX, 100 μg/mL) 以稳定核糖体。

若研究翻译动态(如应激响应),可尝试 Harringtonine(哈林顿碱) 进行起始位点捕获。