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Pymol的使用(三):相互作用分析1
今天我们来学习当我们获得一个结构之后,如何快速地找出蛋白质相互作用的关键氨基酸残基。由于内容比较多,我们将分两期进行介绍,本期介绍基于pymol的工作界面,我们手动地进行寻找互作氨基酸并进行绘图,第二期介绍如何用python程序快速寻找互作氨基酸。
2026-04-26
Pymol的使用(二):显示疏水表面2
在上一期的学习中,我们学习了在Pymol中如何通过简单的代码显示出蛋白质的疏水表面,这一期我们将学习如何用python程序绘制颜值更高的疏水表面图!!!具体教程
2026-04-25
Pymol的使用(一):显示疏水表面
在药物设计中,蛋白质的疏水表面是潜在的药物靶点。许多药物分子和受体分子都含有非极性区域。当药物与受体接近时,两者非极性区域的疏水表面相互作用,通过排挤出中间的有序水分子,使系统的熵值增高,自由能降低,从而形成稳定的药物-受体复合物。通过预测蛋白质的疏水表面,可以确定药物分子可能结合的位点,从而为药物设计提供重要的结构信息。
2026-04-24
从核糖体足迹到翻译调控:高分辨率Ribo-seq在翻译组学中的关键角色
高分辨率Ribo-seq技术通过捕获并测序核糖体保护片段,实现了在单核苷酸分辨率下对mRNA翻译过程的全景式观察。自其问世以来,Ribo-seq已成为多种研究的核心技术手段。尤其是在疾病状态下,如肿瘤或病毒感染过程中,Ribo-seq能够提供传统转录组学无法获取的翻译层级信息,从而揭示调控失衡的分子机制。
2026-04-09
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