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Pymol的使用（七）：蛋白结构比对
在对蛋白质结构分析时，我们通常需要将其与同源蛋白或者功能相似的蛋白进行结构比对，查看两者之间的差异。因此，本期我们学习在pymol中用多种方法对蛋白结构进行比对，比对的结果可以通过RMSD值来量化。
2026-04-30
Pymol的使用（六）：蛋白质的保守性分析
蛋白质中高度保守的氨基酸残基或序列区域通常与蛋白质的功能密切相关。这些保守区域可能是酶的活性位点、配体结合位点或维持蛋白质三维结构的关键区域。通过保守性分析，可以预测未知蛋白质的功能区域。
2026-04-29
Pymol的使用（五）：显示静电势表面
在前面的学习中，我们已经学习了寻找蛋白质的疏水表面，亲水表面以及蛋白质之间的相互作用界面，这期我们将学习如何寻找蛋白质的静电势表面。通过展示蛋白质的静电势表面，我们可以初步判定该蛋白可能的功能和结合口袋，比如说当一个蛋白含有一大片的带正电荷表面时，说明该蛋白很有可能是一个DNA/RNA结合蛋白。接下去我们介绍两种寻找静电势表面的方法。
2026-04-28
Pymol的使用（四）：相互作用分析2
上一期我们学习了在pymol操作界面手动进行互作分子，使我们对pymol的使用有了初步的了解，这期我们通过现有的python代码快速找出互作氨基酸并绘图，下面是具体的操作步骤。
2026-04-27
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